🔸本日の瀬田川洗堰情報！ 本日、洗堰のゲートを全開します。水位や流れが急激に変わり大変危険ですので、川の中には入らず船舶も安全な場所に避難して下さい！ ≪本日の放流変更≫ 放流量 300㎥/s→全開 操作時間 14:00～16:30 ≪６時の琵琶湖水位 +23㎝≫ ≪６時の洗堰放流量 300㎥/s≫

Extracellular rRNA profiling reveals the sinking and cell lysis dynamics of marine microeukaryotes biorxiv.org/cgi/content/sh… #biorxiv_ecology

A bacterium that can’t make its own cell wall without a partner!? Our new isolate from the uncultured phylum Marinimicrobia/SAR406/Marine Group A/Marinisomatota #bacteria #microbiology #ecology doi.org/10.1038/s41564…

Lake Biwa sampling day! It is already like summer ☀

We traced #photosynthesis deep into the history of #Bacteria & #Earth! Vertical #evolution in Terrabacteria, a non-O2-generating origin, later rise of O2 generation and even later Cyanobacteria, & more. On PNAS w @thermo_microbes つか＠国研 PNASNews pnas.org/doi/10.1073/pn…

annualreviews.org/content/journa… The diversity of gene pools carried by different strains of bacteria is maintained due to the control exercised by viral predation that maintains a high strain diversity and facilitates the degradation of dissolved organic matter in the ocean.

Our new preprint! Using two years of seawater metagenomes, we generated 1,065 giant virus genomes and found that viruses with broader niche breadth tended to have greater microdiversity. Additionally, year-round recovery patterns were observed in the viral microdiveristy.

新しいアーキアの「界」プロメテアーカエアティについてのブログ記事がでました。これは英語で、どちらかというと研究者向けに書いた記事になります。日本語の記事については準備中です。 microbiologysociety.org/blog/appreciat…..

DAY 3 of #VoM2024 Our Viral Ecology Session connects the dots between viruses, microbes, and their ecosystems. Our invited speaker Prof Debbie Lindell starts with a view into cyanophage hotspots✨ Followed by selected talks by Yogesh Hooda, Sarah_Esser & Yusuke Okazaki!

Posted a new preprint! Exploration of viral signals in SAGs of lake bacterioplankton community revealed novel virus-host pairs and the broad range of viral infection rate depending on the host's ecological strategy: biorxiv.org/content/10.110…

Joint sampling in Lake Biwa with people from LimnoStation UZH !

Sampling Lake Aoki, a small deep lake in ski resort.

Now published in The ISME Journal! academic.oup.com/ismej/advance-…

東京→熊本→つくば→広島→武漢→琵琶湖→東京の4週間が始まった。京都にいるのは8日しかない。体調優先で乗り切る

京都 宇治の萬福寺の本堂「大雄宝殿」など３棟が国宝指定へ www3.nhk.or.jp/lnews/kyoto/20…

比較ゲノム解析ツール DiGAlign の紹介動画が、「統合TV」で公開されました！ 「DiGAlign を使ってゲノムの変化を可視化する」 togotv.dbcls.jp/20241022.html DiGAlignは、最大300ゲノムの大規模な比較ゲノム解析ができるWebサーバーで（無料）、簡単に使えます！ genome.jp/digalign/

特定研究員2名の公募です（2025年4月着任）。 京都大学化学研究所@宇治キャンパスで、バイオインフォマティクス研究に取り組んでいただく研究員を公募しております。研究内容について事前にご相談いただくこともできます。奮ってご応募ください！

研究室のZhaoさんらの論文です。dsDNAウイルスの類似配列領域を真核生物の全ての系統のゲノムデータ中に徹底的に探索しました。最大16%のゲノム領域がdsDNAウイルス類似配列の例もあり、これまでに知られていないウイルスと宿主の関係が多数浮き彫りになりました。biorxiv.org/content/10.110…

Now published in ISME Communications! academic.oup.com/ismecommun/adv…

優秀な日本人にも進学してもらうにはどうしたら良いかを考えるべきなのに優劣関係なく国籍で切り落とすのは意味が分からなさすぎるし現場を見てなさすぎる yomiuri.co.jp/kyoiku/kyoiku/…