【黒き月】 リリスの卵。 この黒き月を運んできた小天体との衝突が、衛星である月の形成の原因だとされる（ファーストインパクト）。 全ての人間の魂が生まれ、また還るところでもあるガフの部屋である。 日本の第3新東京市地下のジオフロントに位置し、その実体でもある。

【汎用人型決戦兵器人造人間エヴァンゲリオン】 略称はエヴァ。 アダムやリリスをコピーして作られた巨大な生命体。 A.T.フィールドを展開でき、襲来する使徒を殲滅できる唯一の兵器。 操縦できるのは適格者「チルドレン」のみ。

【第3新東京市】 表向きは「将来の首都として建設されている都市」、実態はNERV本部を狙って襲来する使徒の迎撃のための対使徒迎撃要塞都市。 芦ノ湖北岸に位置する。 EVAの武器、電源コードを収納した兵装ビルなどがEVAの戦闘をサポートする。

【サハクィエル】 第10使徒。 衛星軌道上から自らの身体とA.T.フィールドを質量爆弾として落下させ、NERV本部を破壊しようとする。 最大級の使徒とされている。

【イロウル】 第11使徒。 微生物状であり、多くのナノマシンの集合体。 環境に適応するために異常な速度で自己進化する。 NERV本部のメインコンピュータMAGIシステムに侵入・NERV本部を自爆させようとした。

【ガフの部屋】 全ての生命の魂が入れられている部屋、場、座であり、生命はこの部屋で魂を授かり、生まれ、また魂が還るところでもある。 白き月と黒き月がガフの部屋に該当し（つまり2つある）、白き月は使徒（アダム系）の、黒き月は人間（リリス系）のガフの部屋である。

【生命の樹】 劇場版26話において、生命の実と知恵の実の両方を手にし神と等しき存在となっていた初号機が、ロンギヌスの槍の侵食を受け、二つの実が融合され、命の胎芽たるものへと還元された姿。 上下だけでなく前後にも幹が生えており、立体的な十字架のような形をとる。

【N2兵器（エヌツーへいき）】 国連軍・戦略自衛隊が保有する武器のなかで、最大級の破壊力を持つ兵器のこと。 広大な地形を吹き飛ばす威力があるが、使徒に対しては足止め程度にしかならない。 N2地雷、N2爆雷、N2航空爆雷などがある。

【アラエル】 第15使徒。 光る鳥のような形状。 衛星軌道上から可視光エネルギー波によって精神攻撃を仕掛け、弐号機パイロットを活動停止に追い込む。 ゲンドウの指示によりEVA零号機が投擲したロンギヌスの槍により、撃破される。

【リリス】 第2使徒。 アダムとは異なる「生命の源」であり、知恵の実を得た存在。 アダム系を除く全ての地球上の生物の始祖であり、その最終形態として人類（＝第18使徒リリン）を生み出す。 ターミナルドグマに磔にされている白い巨人。

【生命の樹】 劇場版26話において、生命の実と知恵の実の両方を手にし神と等しき存在となっていた初号機が、ロンギヌスの槍の侵食を受け、二つの実が融合され、命の胎芽たるものへと還元された姿。 上下だけでなく前後にも幹が生えており、立体的な十字架のような形をとる。

【ファーストインパクト】 約40億年前に起きた地球規模の災害。 地球が形成されてまもなく、衛星である月が出来る原因となった微惑星と原始地球の衝突＝ジャイアントインパクトのこと。

【サキエル】 第3使徒。 セカンドインパクト以来、15年ぶりに出現した使徒。 人型ではあるが、手足の形状は細く長い。 首にあたる部分はなく、頭部は仮面のような無機質な形状をしている。 近接戦闘、長距離攻撃、光線を使う。

【S2機関】 「エスツーきかん」と呼称されるスーパーソレノイド機関の略称。 使徒が体内に持つ永久機関（生命の実）である。 提唱者である葛城博士は無尽蔵のエネルギーを引き出せると考えていた。 EVA初号機は第14使徒・ゼルエルを捕食することにより、活動限界を克服した。

【ファーストインパクト】 約40億年前に起きた地球規模の災害。 地球が形成されてまもなく、衛星である月が出来る原因となった微惑星と原始地球の衝突＝ジャイアントインパクトのこと。

【松代】 長野県長野市松代町。 NERVの第2実験場が置かれており、EVA3号機の起動実験が行われた。 松代にはMAGI2号が置かれている。

【第2新東京市】 壊滅した旧東京に替わり、遷都された新たな首都。 2001年に建造がはじまり、2003年ごろから首都としての機能を果たすようになった。 所在地は長野県旧松本市。

【セカンドインパクト】 2000年9月13日に起きた世界規模の大災害。 隕石の衝突となっているが、実態は南極で発見された第1使徒アダムを卵にまで還元する際に引き起こされた人為的な爆発である。 人類の半数が失われ多くの都市が水没、日本では四季が無くなり夏が年中続くようになった

【ダミープラグ】 ダミーシステムを用いた赤色のエントリープラグ。 EVAに擬似的な信号パターンを送り込むことにより無人でEVAの運用が可能 NERV側のダミープラグは綾波レイ、EVA量産型には渚カヲルの人格が移植されている

【E計画】 人類補完計画、アダム計画と並ぶNERVが進める3大計画の一つであり、最初に着手された計画。 「アダム再生計画」の通称であり、アダムのコピーを生み出す計画である。 これによりエヴァンゲリオンが建造された。