Parece que tenemos una nueva variante del covid made in Peru. Se llama omicron DJ.1, ha estado creciendo en las últimas semanas y podría estar detrás de la ola actual de casos.🧵 1/n

Este análisis se basa en el último set de #datosabiertos disponibles para Perú, generado por lxs colegas de INS_Perú y compartidos en GISAID Initiative. Llegan hasta la última semana octubre y se suben nuevas secuencias todas las semanas. 2/

Hace unos días les hablé de las múltiples variantes omicrones que han aparecido: Linajes distintos entre sí pero que convergen en las mismas mutaciones de la proteína spike que se asocian a unión de anticuerpos y afinidad por el receptor ACE2. 3/ x.com/pablotsukayama…

Luego de ese post, Federico Gueli 🏳️, colega en Italia y experto cazador de variantes, nos comentó que desde octubre vienen monitoreando un nuevo linaje en Perú, hija de BA.5.1.25. Gracias, Federico! 4/ x.com/siamosolocani/…

BA.5.1.25 es una de las varias hijas de omicron que han estado circulando por el mundo en las últimas semanas. 5/ cov-lineages.org/lineage.html?l…

Pero vemos que en Perú, desde agosto, BA.5.1.25 ha adquirido un par de mutaciones adicionales (S:K444N y S:N460K) que la harían mejor en evadir la unión por anticuerpos. Este patrón lo hemos observado recientemente en varios países. 6/ nature.com/articles/d4158…

Estas mutaciones adicionales le permitirían transmitirse más fácilmente entre personas vacunadas y que han tenido covid hace solo unos meses, lo cual le da una ventaja sobre los demás sublinajes y hace que aumente en frecuencia en el tiempo. 7/

Al tener nuevas mutaciones y aumentar su frecuencia local, podemos solicitar que se le asigne un nuevo ‘nombre’ en el sistema de clasificación #pango. En este caso le pusieron ‘DJ.1’ (abreviación de BA.5.1.25.1). Me encanta el nombre, DJ.1 🎧 8/ github.com/cov-lineages/p…

La mayoría de secuencias DJ.1 proviene de Loreto, donde aumenta rápidamente desde octubre. Quizá por esto Loreto empezó antes su ola de casos (aunque también debemos considerar sesgos de muestreo.) DrJuanCelis 9/

Cuando se le compara con otras variantes circulantes, vemos que DJ.1 crece rápidamente desde setiembre. Se estima que seguirá creciendo en las próximas semanas. 10/ cov-spectrum.org/explore/World/…

Los últimos datos de Perú son de hace un mes. Será muy interesante monitorear a DJ.1 en las próximas semanas y ver cómo se comporta en Lima frente a la introducción de BQ.1* y XBB.* que han causado olas recientes en Europa y Asia. 11/ x.com/MoritzGerstung…

No hay evidencia que esta nueva variante sea más virulenta que las cientos de omicrones que circulan actualmente por el mundo. Pero es interesante ver que la evolución vuelve a converger en este rincón del mundo. 12/

DJ.1 no habría sido identificada si INS no siguiera secuenciando miles de genomas SC-2 en 2022. Es importante que se sigan financiando programas de vigilancia genómica en todo el mundo y no solo en países ricos. 13/ nature.com/articles/s4146…

DJ.1 también ilustra por qué es importante que los genomas se compartan de forma abierta: Científicos en Europa identifican patrones interesantes en datos compartidos por Perú y luego nos avisan de vuelta para que lo investiguemos e informemos. This is the way, INS 😉 14/

Gracias totales a colegas en todo el mundo que siguen generando secuencias para el estudio de este virus. Y a los equipos que desarrollan herramientas gratuitas para catalogar y analizar estos enormes sets de datos. @NextStrain @PangoNetwork GenSpectrum Microreact 15/

Aquí un excelente artículo para entender mejor la evolución de omicron en 2022. 16/ virological.org/t/sars-cov-2-e…

Esta información es muy preliminar. Analizaremos de cerca la evolución de DJ.1 en los datos que se suban en las próximas semanas. Anticipo un aumento en frecuencia en Lima y competencia con BQ.1* y XBB.*. Veremos cuál gana. Seguiremos informando 🖖 17/

9 evidencias científicas sobre la importancia de tener buenos hábitos de vida y promover un envejecimiento saludable: alimentación, ejercicio, descanso, tabaco, sueño, etc. Agredezco RT.

#SeBusca a Hilario Cusihuallpa Baez, es de Ancahuasi y vino con la delegación de Anta a la protesta #FueraDina. Visto hoy por última vez en la av. nicolas de pierola. Se cree que se le ha detenido, porque no contesta celular. Si tienen info, escríbanme por DM.

#SeBusca a Hilario Cusihuallpa Baez, es de Ancahuasi y vino con la delegación de Anta a la protesta #DinaRenuncia. Visto hoy por última vez en la av. nicolas de pierola. Se cree que se le ha detenido, porque no contesta celular. Abajo su foto. Si tienen info, escríbanme por DM.