Delighted with our recent publication (OA@Nature rdcu.be/cTPLe): Live-seq, transforming #scRNAseq from a snapshot into a temporal profiling tool by deriving live cell transcriptomes. Huge tx to Wanze Chen, Orane, Julia Vorholt & the team for daring to think outside the box!

Beautiful work on rhabdomyosarcoma, the most common soft tissue sarcoma in #children. Relies on an innovative 3D-#Organoid model, grown out of patient cells which mimics tumors' histological and molecular specificities. And of course #Singlecell analyses ! #Cancer #Bioinformatics

Très heureuse de faire partie de cette incroyable aventure ! Ça fait maintenant 6 mois que j'y suis, et je continue de me dire que j'aurais pas pu rêver mieux comme 1ère expérience "post-doc" 😃 #OpenScience #Bioinformatics #Interoperability

Je repartage cet appel à donneuses ! 🩸 👉 Nous recherchons actuellement surtout des femmes atteintes ⚡️d'endométriose ⚡️ qui seraient prêtes à donner leur sang menstruel pour aider la recherche 👈 N'hésitez pas à partager et à en parler autour de vous ! 🗣️

Chaque Prix Nobel français le dit, depuis des décennies. Mais jamais aucun.e.s des politiques ne l'entend

The importance of this👇cannot be underscored: #caner is a unique evolutionary process. tumors are expected to be genetically v distinct. each tumor = its own world. Therefore: #scRNAseq analyses of cancer tissue data SHOULD NOT‼️BLINDLY include data integration as 1st step🧵

Only two weeks left to apply! Application reviews and interviews start this week, so early birds are more than welcome :)

10 courses/books to learn bioinformatics 🧵👇

Light-Seq an inexpensive technology that enables to visually identify interesting subsets of cells, sequence their transcriptomes, and further image the same cells after sequencing. #SingleCell #RNAseq #SpatialTranscriptomics www-nature-com.insb.bib.cnrs.fr/articles/s4159…

C'est le jour J pour l'école de bioinformatique niveau 1. Participants et encadrants commencent à faire connaissance #ebaii22 #bioinformatique

Promotion 2022, sous le soleil de Roscoff #ebai22 #bioinformatique

📢 Two postdoc positions in Machine Learning for single-cell genomics open in my team IBENS, PRAIRIE Institute and soon INSTITUT PASTEUR in collaboration with Gabriel Peyré École normale supérieure | PSL PM me if interested RT please🙏! #hiring #postdoc #MachineLearning #singlecell

[Annonce] Je suis à la recherche d'un stagiaire de M1 en bioinformatique. Le stage portera sur l'identification et l'analyse de régions de régulation chez l'annélide Platynereis dumerilii, dans le contexte de la régénération, et via des méthodes de génomique comparative.

1/n Single-cell data analysis is complex with many tools to choose from - but which ones work best and should be used when? Led by @lukasheumos and Anna Schaar, we wrote a free online book that aims to guide single-cell data analysts: sc-best-practices.org

En 2023, venez suivre notre formation "Analyse de données NGS", du 4 au 9 juin pour le niveau avancé, et du 5 au 10 novembre pour le niveau débutant ! #ebaii23

This is mind blowing. I just don't understand what happened, Seurat is not mentioned😅 #singlecell #ChatGPT

In case you missed it, important thread on quantification in #scRNAseq of spliced vs unspliced reads, with a careful examination of recent benchmarks. From Dongze He @CSoneson 𝕐 (@[email protected]) x.com/nomad421/statu…

📢 Rejoignez-nous pour participer à nos projets R&D en 🧬 séquençage à haut débit ! Nous recherchons : – un•e assistant•e ingénieur•e en génomique contrat 12-18 mois 👉 lnkd.in/eaG5XKAj – un•e ingénieur•e en bioinformatique contrat 12-18 mois.👉lnkd.in/e2SE-dhH

In a new study published today in nature, biomedical engineer Rong Fan and collaborators demonstrated the ability to spatially map two crucial components of our genetic makeup simultaneously, the epigenome and the transcriptome: seas.yale.edu/news-events/ne…

This is the best video to introduce a computational biology course. There will never be a better one x.com/fan_of_gpu/sta…