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Nicolas Pons

@metabioinfo

Research Engineer - Technical head of bioinformatics platform at @mgpslab @INRAE_France @INRAE_DPT_MICA @lefrenchgut

#microbiome #metagenomics #bigdata

ID: 144882764

linkhttp://www.mgps.eu calendar_today17-05-2010 15:13:56

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Le French Gut - Le microbiote français (@lefrenchgut) 's Twitter Profile Photo

Le French Gut, ça commence aujourd'hui et voici comment y participer !😃 Rejoignez Le French Gut, faites avancer la science du microbiote. #santé #microbiote #lefrenchgut 👉Pour s'inscrire, rendez-vous sur : lefrenchgut.fr INRAE

Geneviève HéryArnaud (@genevieve_hery) 's Twitter Profile Photo

Aujourd'hui dans le Le Figaro Sciences, Prigent Anne décrypte le projet #FrenchGut porté par l'INRAE Joel Dore. Plaisir de donner mon point de vue sur ce projet d'importance majeure. "Le #microbiote intestinal, tout un monde à cartographier" lefigaro.fr/sciences/le-mi…

INRAE (@inrae_france) 's Twitter Profile Photo

[#INRAEdanslesmedias] « Apolline matin – Le parti pris » Philippe Mauguin, PDG #INRAE en direct le 26/09 avec Charles Magnien : "Doit-on modifier nos habitudes alimentaires pour soutenir les agriculteurs ? » Autre sujet abordé le lancement de Le French Gut - Le microbiote français Le replay : url.inrae.fr/3SPct8J

[#INRAEdanslesmedias]
« Apolline matin – Le parti pris » <a href="/PhMauguin/">Philippe Mauguin</a>, PDG #INRAE en direct le 26/09 avec <a href="/tcharlz/">Charles Magnien</a> : "Doit-on modifier nos habitudes alimentaires pour soutenir les agriculteurs ? »
Autre sujet abordé le lancement de <a href="/lefrenchgut/">Le French Gut - Le microbiote français</a>
Le replay : url.inrae.fr/3SPct8J
MetaGenoPolis (@mgpslab) 's Twitter Profile Photo

MetaGenoPolis 𝐞𝐬𝐭 𝐝𝐨𝐮𝐛𝐥𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐜𝐞𝐫𝐭𝐢𝐟𝐢𝐞́ 𝐚𝐯𝐞𝐜 𝐥𝐞 𝐫𝐞𝐧𝐨𝐮𝐯𝐞𝐥𝐥𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐝𝐞 𝐥𝐚 𝐈𝐒𝐎 𝟗𝟎𝟎𝟏 𝐞𝐭 𝐥’𝐨𝐛𝐭𝐞𝐧𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐝𝐞 𝐥𝐚 𝐜𝐞𝐫𝐭𝐢𝐟𝐢𝐜𝐚𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐈𝐒𝐎 𝟐𝟕𝟎𝟎𝟏! Bravo à l'équipe 👏 INRAE INRAE Île-de-France INRAE Microbiologie et Chaîne Alimentaire

<a href="/MgpsLab/">MetaGenoPolis</a>  𝐞𝐬𝐭 𝐝𝐨𝐮𝐛𝐥𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐜𝐞𝐫𝐭𝐢𝐟𝐢𝐞́ 𝐚𝐯𝐞𝐜 𝐥𝐞 𝐫𝐞𝐧𝐨𝐮𝐯𝐞𝐥𝐥𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐝𝐞 𝐥𝐚 𝐈𝐒𝐎 𝟗𝟎𝟎𝟏 𝐞𝐭 𝐥’𝐨𝐛𝐭𝐞𝐧𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐝𝐞 𝐥𝐚 𝐜𝐞𝐫𝐭𝐢𝐟𝐢𝐜𝐚𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐈𝐒𝐎 𝟐𝟕𝟎𝟎𝟏!
Bravo à l'équipe 👏
<a href="/INRAE_France/">INRAE</a> <a href="/INRAE_IDF/">INRAE Île-de-France</a> <a href="/INRAE_DPT_MICA/">INRAE Microbiologie et Chaîne Alimentaire</a>
Nicolas Pons (@metabioinfo) 's Twitter Profile Photo

Nice work from our team. Behind the scenes by Victoria Meslier (1st author of the paper) here : researchdata.springernature.com/posts/a-new-da…

PacBio (@pacbio) 's Twitter Profile Photo

Exciting work from Mathieu J Almeida’s team on benchmarking sequencing platforms for microbial metagenomics. They shared, “The PacBio Sequel II provided the lowest substitution error rate... and produced the most accurate assemblies” go.nature.com/3ihddGp #PoweredByPacBio

Exciting work from <a href="/MathieuJAlmeida/">Mathieu J Almeida</a>’s team on benchmarking sequencing platforms for microbial metagenomics. They shared, “The PacBio Sequel II provided the lowest substitution error rate... and produced the most accurate assemblies”

go.nature.com/3ihddGp

#PoweredByPacBio
anton newcombe (@antonnewcombe) 's Twitter Profile Photo

Bout des doigts - The Brian Jonestown Massacre youtu.be/Ajdp18kKZDE i love france so much, i do this for culture. our culture. this is our time 🇫🇷

Christophe Cassou (@cassouman40) 's Twitter Profile Photo

#QuiAuraitPuPrédire la crise climatique aux effets spectaculaires encore cet été en 🇫🇷? » La petite phrase d'Emmanuel Macron a été vécue comme une claque par les scientifiques, au départ sidérés, puis en colère ; au-delà des émotions, elle suscite aussi bcp d’inquiétude. Un 🧵👇

#QuiAuraitPuPrédire la crise climatique aux effets spectaculaires encore cet été en 🇫🇷? »
La petite phrase d'<a href="/EmmanuelMacron/">Emmanuel Macron</a> a été vécue comme une claque par les scientifiques, au départ sidérés, puis en colère ; au-delà des émotions, elle suscite aussi bcp d’inquiétude.
Un 🧵👇
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𝐏𝐚𝐭𝐢𝐞𝐧𝐭𝐬 𝐰𝐢𝐭𝐡 𝐌𝐮𝐥𝐭𝐢𝐩𝐥𝐞 #𝐒𝐜𝐥𝐞𝐫𝐨𝐬𝐢𝐬 𝐰𝐡𝐨 𝐝𝐨 𝐧𝐨𝐭 𝐫𝐞𝐥𝐚𝐩𝐬𝐞 𝐰𝐢𝐭𝐡𝐢𝐧 2 𝐲𝐞𝐚𝐫𝐬 𝐚𝐫𝐞 𝐞𝐧𝐫𝐢𝐜𝐡𝐞𝐝 𝐰𝐢𝐭𝐡 2 𝐚𝐧𝐭𝐢-𝐢𝐧𝐟𝐥𝐚𝐦𝐦𝐚𝐭𝐨𝐫𝐲 𝐬𝐩𝐞𝐜𝐢𝐞𝐬 genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.11… MetaGenoPolis Novo Nordisk Foundation INRAE

Le French Gut - Le microbiote français (@lefrenchgut) 's Twitter Profile Photo

Pourquoi une phase pilote Le French Gut ?😃 C'est un test essentiel qui permet de lancer le projet en conditions réelles mais à échelle réduite : 3000 participants. Elle nous permet de valider la faisabilité technique et d'ajuster si nécessaire ! MetaGenoPolis Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP) INRAE

Pourquoi une phase pilote Le French Gut ?😃 C'est un test essentiel qui permet de lancer le projet en conditions réelles mais à échelle réduite : 3000 participants. Elle nous permet de valider la faisabilité technique et d'ajuster si nécessaire !

<a href="/MgpsLab/">MetaGenoPolis</a> <a href="/APHP/">Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP)</a> <a href="/INRAE_France/">INRAE</a>
Florian Plaza Oñate (@fplazaonate) 's Twitter Profile Photo

Lindsay Goulet and her supervisor Guillaume GAUTREAU from MetaGenoPolis will present our innovative approach to detect well-to-well contamination in metagenomic data during the "Bioinformatics in France" session of the #ISMBECCB2023 congress. We are eager to receive your feedback!

Le French Gut - Le microbiote français (@lefrenchgut) 's Twitter Profile Photo

Le French Gut - Le microbiote français était à la rencontre du grand public au festival Festival Double•Science (fermé) ce week end ! Nous avons pu parler du #microbiote au grand public et intervenir lors d'une table ronde sur la #communication dans un projet de science participative INRAE MetaGenoPolis #santé

<a href="/lefrenchgut/">Le French Gut - Le microbiote français</a>  était à la rencontre du grand public au festival <a href="/double_science_/">Festival Double•Science (fermé)</a> ce week end ! 

Nous avons pu parler du #microbiote au grand public et intervenir lors d'une table ronde sur la #communication dans un projet de science participative

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Michel Cymes a revêtu le t-shirt Le French Gut pour parler du #microbiote intestinal et de l'importance de participer au projet #lefrenchgut ! 👍 Un grand merci pour votre soutien 😉 INRAE Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP) MetaGenoPolis consortium #lefrenchgut #science #innovation #santé #médecine

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𝐎𝐧 𝐞𝐧 𝐚 𝐝𝐚𝐧𝐬 𝐥𝐞 𝐯𝐞𝐧𝐭𝐫𝐞 ! Tous ensemble, aidons à mieux prévenir et soigner les maladies chroniques en accélérant la #recherche sur le #microbiote. 𝐒𝐨𝐮𝐭𝐞𝐧𝐞𝐳 𝐥𝐞 𝐩𝐫𝐨𝐣𝐞𝐭 𝐋𝐞 𝐅𝐫𝐞𝐧𝐜𝐡 𝐆𝐮𝐭 ! INRAE Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP) consortium #lefrenchgut #santé

Guillaume GAUTREAU (@guillaumegautre) 's Twitter Profile Photo

1/9 🚨 New preprint alert! Frustrated by strange results with your metagenomic data? Meet CroCoDeEL, an accurate, easy-to-use tool to detect and quantify cross-sample contamination—no need for negative controls or sample positions! 🔗 doi.org/10.1101/2025.0…